For final year UG/PG girls in Chemistry & related fields: Get industry-ready with a certified training program in the chemical sector with We-Chemie.
Click here for more details. Apply here!

Blast - Kannada

Play
Current Time 0:00
/
Duration Time 0:00
Remaining Time -0:00
Loaded: 0%
Progress: 0%
0:00
Fullscreen
00:00
Mute
Captions
  • captions off
  • English
  • Kannada

235 visits

  1. Instruction Sheet
  2. Installation Sheet
  3. Report Missing Component
  4. Post your Question on the Forum
Outline:
'ಕ್ವೆರಿ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್' ಗಾಗಿ, NCBI BLAST ಸರ್ವೀಸ್ ಮೂಲಕ ಇಂಟರ್ನೆಟ್ ನ ಮೇಲೆ BLAST ಅನ್ನು ರನ್ ಮಾಡುವುದು
'ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್' ಗಾಗಿ blast ಅನ್ನು ರನ್ ಮಾಡಲು, NCBIWWW ಮೊಡ್ಯೂಲ್ ನಲ್ಲಿ qblast ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವುದು
ಔಟ್ಪುಟ್ xml ಫೈಲ್ ಅನ್ನು home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡುವುದು
Bio.Blast.Record ಮೊಡ್ಯೂಲ್ ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಫಂಕ್ಷನ್ ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು BLAST ಔಟ್ಪುಟ್ (xml) ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಪಾರ್ಸ್ ಮಾಡುವುದು
Width:832 Height:624
Duration:00:07:49 Size:4.1 MB

Show video info

Pre-requisite

Writing Sequence Files

  Assignment

Code files

  • BLAST-Codefiles/
  • BLAST-Codefiles/blast.py
  • BLAST-Codefiles/blas-prot.py
  • BLAST-Codefiles/Blast-fasta.py
  • BLAST-Codefiles/Blast-seq-rec.py

Script

Slides

  • BLAST Slides/
  • BLAST Slides/blas-prot.py
  • BLAST Slides/st-logo-new.png
  • BLAST Slides/Blast.tex
  • BLAST Slides/Blast.pdf
  • BLAST Slides/Blast-fasta.py
  • BLAST Slides/Blast-seq-rec.py