whenever i try to fix hydrogen and minimize, hydrogen adds only in the backbone of protein structure. the oxygen molecules that present beside the protein does not get the hydrogen molecule. i tried it other pdb files, but there is same issue. is it a malfunction? give me suitable solution.
In Jmol version 14.31.2, hydrogen is not getting added after clicking on “add hydrogen” option from the model kit menu. How to add the hydrogen atoms to the molecule?
In Jmol version 14.31.2, the code file provided for human insulin opens in cartoon style. How do I get the same display style as shown in video?
219 visits
Outline: പ്രോട്ടീൻ ഡാറ്റാബാങ്കിൽ (പി.ഡി.ബി) നിന്നുള്ള പ്രോട്ടീനുകളുടെ ലോഡ് സ്റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് .pdb ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക. ഇൻസുലിൻ ഉപയോഗിച്ച് പി.ഡി.ബി കോഡ് (4EX1) ഉപയോഗിച്ച് 3D ഘടന കാണുക. ജല തന്മാത്രകളില്ലാത്ത റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് കാണുക. സെക്കണ്ടറി റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് ഡിസ്പ്ലേ പരിഷ്ക്കരിക്കുക. ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകളും ഡായ് സൾഫൈഡ് ബോണ്ടുകളും ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക
പ്രോട്ടീൻ ഡാറ്റാബാങ്കിൽ (പി.ഡി.ബി) നിന്നുള്ള പ്രോട്ടീനുകളുടെ ലോഡ് സ്റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് .pdb ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക. ഇൻസുലിൻ ഉപയോഗിച്ച് പി.ഡി.ബി കോഡ് (4EX1) ഉപയോഗിച്ച് 3D ഘടന കാണുക. ജല തന്മാത്രകളില്ലാത്ത റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് കാണുക. സെക്കണ്ടറി റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് ഡിസ്പ്ലേ പരിഷ്ക്കരിക്കുക. ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകളും ഡായ് സൾഫൈഡ് ബോണ്ടുകളും ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക
Show video info
Pre-requisite