The Tutorials in this series are created using Jmol 12.2.2 Jmol v 14.32.80 on Ubuntu 12.04, Ubuntu Linux OS v 20.04. Jmol is an open-source Java viewer for chemical structures and biomolecules in 3D. It does not require 3D acceleration plugins. 3D models created by using Jmol may be used as a teaching tool or for research in chemistry and biochemistry. It is free and open source software, written in Java, it runs on Windows, Mac OS X, Linux and Unix systems. Read more
Foss : Jmol Application - Bengali
Outline: ফাংশনাল গ্রুপের সাথে আণবিক মডেলে হাইড্রোজেন প্রতিস্থাপিত করা বন্ধন যোগ এবং মুছে ফেলা পরমাণু যোগ এবং মুছে ফেলা Pop-up মেনু (কনটেক্সচুয়াল মেনু)
Outline: মডেল ঘোরানো, জুম করা, সরানো এবং স্পিন করা ভিউ বদলানো প্রদর্শনের শৈলী বদলানো পরমাণু এবং বন্ধনের আকার ও রঙ বদলানো অক্ষ এবং বাউন্ড বাক্স বিভিন্ন ফাইল ফর..
Outline: কার্বক্সিলিক অ্যাসিডের মডেল তৈরি করা। উদাহরণস্বরূপ, অ্যাসিটিক অ্যাসিড নাইট্রোঅ্যালকেনের মডেল তৈরি করা। উদাহরণস্বরূপ, নাইট্রোইথেন এলিমেন্টের চিহ্ন দ্বারা মডেলে পরমাণু লেবেল করা স..
Outline: স্ক্রিপ্ট কমান্ড সম্পর্কে স্ক্রিপ্ট কমান্ড লেখা স্ক্রিপ্ট কনসোলের ব্যবহার স্ক্রিপ্ট কমান্ড ব্যবহার করে প্রোপেনের প্রদর্শন বদলানো পরমাণু এবং বন্ধনের রঙ পরিবর্তন করা পরমাণু এবং ..
Outline: Alicyclic (অ্যালিসাইক্লিক) অণুর মডেল তৈরী করা। উদাহরণস্বরূপ: সাইক্লোহেক্সেন Aromatic (অ্যারোম্যাটিক) অণুর মডেল তৈরী করা। উদাহরণস্বরূপ: বেঞ্জিন অণুর সারফেস টোপোলজি প্রদর্শন করা। উ..
Outline: 'PubChem' ডাটাবেস রাসায়নিক কাঠামো থেকে অণু আঁকা ফেনলের কাঠামো এঁকে তা Para-amino (প্যারা-অ্যামিনো ) ফেনলে রূপান্তর করা কোলেস্টেরলের কাঠমো আঁকা এবং দ্বি-বন্ধন ও পার্শ্ব চেন লক্ষন..
Outline: * ক্রিস্টালোগ্রাফি ওপেন ডেটাবেস থেকে CIF (Crystallographic Information File) ডাউনলোড করা * Jmol এ CIF ফাইল খোলা * প্যানেলে ইউনিট সেল এবং ইউনিট সেল প্যারামিটার দেখানো * বিভিন্ন ..
Outline: Protein Data Bank (PDB) থেকে প্রোটিনের কাঠামো লোড করা ডাটাবেস থেকে .pdb ফাইল ডাউনলোড করা PDB কোড ((4EX1)) ব্যবহার করে ইনসুলিনের 3D কাঠামো দেখা জলের অণু ছাড়া প্রোটিনের কাঠামো দে..
Outline: পিডিবি কোড ব্যবহার করে Hexokinase এর লোড স্ট্রাকচার সেকেন্ডারি স্ট্রাকচারের ডিসপ্লে পরিবর্তন করা সক্রিয় সাইটে অ্যামাইনো অ্যাসিডের রেসিডিউ লক্ষনীয় করা সাব্সট্রেট লক্ষনীয় করা কো..
Outline: 1. মিথেন অণুতে পরমাণুর মাধ্যমে লাইন আঁকা যা হল C2 এবং C3 রোটেশনাল অক্ষ 2. অক্ষ বরাবর অণু স্পিন এবং ঘোরানো 3. মিথেন অণুতে পরমাণুর মাধ্যমে প্রতিফলিত প্লেন আঁকা 4. allene এবং মিথেন..
Outline: স্ক্রিপ্ট কমান্ড ব্যবহার করে Jmol অ্যানিমেশন উদাহরণস্বরূপ ইথেন এবং হিমোগ্লোবিন ব্যবহার করে অ্যানিমেশন প্রদর্শন করা move, delay, slab, loop এবং capture কীওয়ার্ডের সাথে স্ক্র..
Foss : Jmol Application - English
Outline: Learn about Jmol Application Important uses of Jmol Official website to download Jmol Information regarding Installation on various operating systems Download, extract and r..
Outline: Brief description about Jmol Application. Software requirements. Prerequisites. Open the Jmol Application on Ubuntu/ Linux system. Explain program interface (Menu Bar, Tool b..
Outline: Substitute the hydrogen in molecular model with a functional group. Add and delete bonds Add and delete atoms Pop-up-menu (Contextual menu)
Outline: Rotate, zoom, move and spin the model Modify the view Change the style of the display. Change the size and color of atoms and bonds. Axes and bound box ..
Outline: Create a model of Carboxylic acid. Example, Acetic acid. Create a model of Nitroalkane. Example, Nitroetane. Label atoms in a model with symbol of the element. Label atoms in ..
Outline: Add Boron to the list of elements in the model kit menu. Minimize the energy of Borane molecule. Measure bond angles in Borane molecule. Add Silicon to the list of elements in..
Outline: Load a structure from the database. Convert a 3D model to 2D drawing using the 2D-Editor tool. Save the 2D drawing in PNG format. Edit the 2D drawing. Create 2D drawing using t..
Outline: About Script Commands. How to write Script commands. How to use Script console. Change display of propane by using script commands. Change the color of atoms and bonds. Change..
Outline: Load model of water from the database. Display the lone pair of electrons on the oxygen atom using script commands. Edit the command to change the color of the lobe representing ..