Search Tutorials
The Tutorials in this series are created in UCSF Chimera 1.13 on Ubuntu 14.04. UCSF Chimera is a program for interactive visualization and analysis of molecular structures and related data. Using Chimera, one can generate high-quality images and animations. Chimera was designed with extensibility and programmability in mind. It is largely implemented in Python, with certain features coded in C++ for efficiency. Read more
Foss : UCSF Chimera - English
Outline: Create structures of small molecules, peptides and DNA fragments. Modify structure (add and delete atoms). Minimize energy. Join models.
Intermediate

Foss : UCSF Chimera - English
Outline: Measure distance between atoms in the structure. Show hydrogen bonds. Identify non-polar interactions. Rotate bonds in the residues to get different rotamers.
Intermediate

Foss : UCSF Chimera - English
Outline: Superimpose and compare different structures of the same protein. Morph conformations and create a trajectory.
Intermediate

Foss : UCSF Chimera - English
Outline: Change attributes of atoms, residues and models. Color atoms in a protein according to B-factor values. Color residues according to kdHydrophobicity values.
Advanced

Foss : UCSF Chimera - English
Outline: Adjust background lighting and effects. Create scenes for animation. Place scenes along a timeline. Record a movie of the resulting animation.
Advanced

Foss : UCSF Chimera - English
Outline: Show Axes, Planes and Centroids for structure of Green Fluorescent Protein. Show 2D-Labels. Draw Arrows. Clip a model of Myoglobin using Per-Model clipping tool.
Advanced

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર એક સ્ટ્રક્ચર ખોલવું. PDB ડેટાબેઝમાંથી pdb ફાઇલ્સ ડાઉનલોડ કરવી. સ્ટ્રકચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું. સ્ટ્રકચરને સ્કેલ અને કલીપ કરવી. મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉ..
Basic

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: એટમ્સ અને રેસિડયુઝના લેબલ્સ બતાવવા. એટમ્સ અને રેસિડ્યુઝને સિલેક્ટ મેનુ દ્વારા અથવા પિકિંગ દ્વારા સિલેક્ટ કરવા. રેસિડ્યુઝના રંગ અને દેખાવ બદલવા. એટમ્સને ઉમેરવા, કાઢી નાખવા અથવા..
Basic

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: ડિસ્પ્લેને એટમ્સમાં બદલવા કમાન્ડ ટાઈપ કરવા. રીબન્સને દેખાડવા અથવા અદૃશ્ય કરવા. અમીનો એસિડ રેસિડ્યુઝના રંગ બદલવા. પ્રત્યેક રેસિડયુઝના લેબલ આપવા. સોલ્વન્ટ મોલેક્યુલ્સને દૂર કરવ..
Basic

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: પ્રોટીન અને DNA માટેના સરફેસિસ બતાવવા. પ્રોટીન સરફેસ માટેની ઈમેજીસ બનાવો જે (i) Amino acid hydrophobicity, (ii) Electrostatic Potential થી રંગીત થયેલ હોય. વિભિન્ન વ્યૂઇંગ..
Basic

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: નાના મોલેક્યુલ્સના સ્ટ્રક્ચર્સ બનાવવા,પેપ્ટાઈડ્સ અને DNA ફ્રેગમેન્ટ્સ. સ્ટ્રક્ચરને બદલવું (એટમ્સ ઉમેરવા અને કાઢી નાખવા). એનર્જીને મિનિમાઈઝ(ન્યુનત્તમ) કરવી. મોડેલ્સને જોડવા.
Intermediate

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: સ્ટ્રક્ચરમાં એટમ્સ વચ્ચેનું અંતર માપવું. હાઇડ્રોજન બોન્ડ્સને બતાવવા. નોન-પોલર ઈન્ટરેક્શન્સને ઓળખવા. જુદા જુદા રોટેમર્સ મેળવવા રેસિડયુઝમાં બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.
Intermediate

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: '''Superimpose''' અને સમાન પ્રોટીનના જુદા જુદા સ્ટ્રક્ચર્સને સરખાવવું. '''conformations'''ને મોર્ફ કરવાનું અને એક '''trajectory''' બનાવવી.
Intermediate

14.Attributes
Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: એટમ્સ, રેસિડ્યુઝ અને મોડલ્સના '''attributes''' બદલવા. '''B-factor''' મૂલ્યોને આધારે પ્રોટીનમાં એટમ્સને રંગ આપવા. '''kdhydrophobicity''' મૂલ્યોને આધારે રેસિડયુઝને રંગ આપવા.
Advanced

15.Animation
Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: '''background lighting''' અને '''effects'''ને વ્યવસ્થિત કરવી. એનિમેશન માટે દ્રશ્યો બનાવવા. '''Timeline''' સાથે દૃશ્યોને સ્થાપિત કરવા. પરિણામરૂપે મળતા એનિમેશનનું ફિલ્મ બનાવો.
Advanced

Foss : UCSF Chimera - Gujarati
Outline: સ્ટ્રક્ચર '''Green Fluorescent Protein'''ના '''Axes, Planes''' અને '''Centroids''' દેખાડવા. '''2D-Labels''' દેખાડવા. '''Arrows''' દોરવા. '''Per-Model clipping tool''' દ્વારા મ..
Advanced

Foss : UCSF Chimera - Hindi
Outline: Chimera विंडो पर स्ट्रक्चर खोलना PDB डेटाबेस से pdb फाइल्स डाउनलोड करना स्ट्रक्चर को चलाना, घुमाना और ज़ूम करना स्ट्रक्चर को स्केल और क्लिप करना मेनू बार में मेनुस उपयोग करक..
Basic

Foss : UCSF Chimera - Hindi
Outline: परमाणुओं और रेसीड्यूज़ के लिए लेबल्स दिखाना Select menu या Picking के द्वारा परमाणुओं और रेसीड्यूज़ को चुनना रेसीड्यूज़ का प्रदर्शन और रंग बदलना परमाणुओं को जोड़ना, डिलीट करना औ..
Basic

Foss : UCSF Chimera - Hindi
Outline: कमांड्स टाइप करना, डिस्प्ले को परमाणुओं में बदलना रिबन्स को दिखाना और छिपाना एमिनो एसिड रेसीड्यूज़ का रंग बदलना एक एक रेसीड्यू को लेबल करना सॉल्वेंट अणुओं को हटाना विभिन्..
Basic

Foss : UCSF Chimera - Hindi
Outline: स्ट्रक्चर में परमाणुओं के बीच की दूरी नापना हाइड्रोजन बांड्स दिखाना नॉन-पोलर इंटरेक्शन्स पहचानना भिन्न-भिन्न रोटामर्स प्राप्त करने के लिए रेसीड्यूज़ में बांड्स को घुमाना
Intermediate
