The Tutorials in this series are created using Jmol 12.2.2 Jmol v 14.32.80 on Ubuntu 12.04, Ubuntu Linux OS v 20.04. Jmol is an open-source Java viewer for chemical structures and biomolecules in 3D. It does not require 3D acceleration plugins. 3D models created by using Jmol may be used as a teaching tool or for research in chemistry and biochemistry. It is free and open source software, written in Java, it runs on Windows, Mac OS X, Linux and Unix systems. Read more
Foss : Jmol Application - Khasi
Outline: • Download ki CIF (Crystallographic Information File) naka Crystallography Open Database (COD). • Plie ïaki CIF files haka Jmol. • Display ki unit cell bad unit cell parameters ..
Outline: • Load ki structures jong ki proteins naka Protein Data Bank (PDB). • Download ki .pdb files naka database. • Peit ïaka 3D structure jong u Insulin pyndonkam u PDB code (4EX1). ..
Outline: • Load ki structure jong u Hexokinase pyndonkam u PDB code. • Pynpher ïaka display jong u secondary structure. • Highlight ïaki amino acid residues haka active site. • Highligh..
Outline: • Dro ki laiñ (C2 bad C3 rotational axes) lyngba ki atoms ha u methane molecule. • Spin bad rotate ïa u molecule ha shilynter u axis. • Draw ka reflection plane lyngba ki atoms ..
Outline: Jmol animation pyndonkam ki script commands. ka jingpyni nuksa ia ki animation pyndonkam u ethane bad hemoglobin. Ki Script commands ryngkat ki keywords, move, delay, slab, l..
Foss : Jmol Application - Malayalam
Outline: Jmol ആപ്ലികേഷൻ ച്ചുള്ള ചെറിയ വിവരണം. സോഫ്റ്റ്വെയർ ആവശ്യകതകൾ. മുൻവ്യവസ്ഥകൾ. ഉബുണ്ടു / ലിനക്സ് സിസ്റ്റത്തിൽ Jmol ആപ്ലികേഷൻ തുറക്കുക. പ്രോഗ്രാം ഇന്റർഫേസ് വിശദീകരിക്കുക (മെനു ബാറി..
Outline: ഒരു ഫങ്ഷണൽ ഗ്രൂപ്പ് ഉപയോഗിച്ച് ഹൈഡ്രജനെ മോളിക്യൂളർ മോഡലിൽ മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുക. ബോണ്ടുകൾ ചേർക്കുക, ഇല്ലാതാക്കുക ആറ്റോമുകൾ ചേർക്കുക, ഇല്ലാതാക്കുക പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു കോണ്ടെസ്റ്റുൾ മ..
Outline: മോഡിലേക്ക് റൊട്ടേറ്റ്‌ ചെയുകക് , സൂം ചെയ്യുക, നീക്കുക, സ്പിൻ ചെയ്യുക കാഴ്ച പരിഷ്കരിക്കുക ഡിസ്പ്ലേയുടെ ശൈലി മാറ്റുക. ആറ്റങ്ങളും ബോന്ഡുകളുടെ വലിപ്പവും വർണ്ണവും മാറ്റുക..
Outline: കാർബോക്സ്ലീക് ആസിഡിന്റെ മോഡൽ ഉണ്ടാക്കുക. ഉദാഹരണം, അസറ്റിക് ആസിഡ്. നിട്രോക്കൽകെന്റെ ഒരു മാതൃക സൃഷ്ടിക്കുക. ഉദാഹരണം, നൈട്രോതെയ്ൻ. എലമെന്റ് ന്റെ സിമ്പോൾ ഉള്ള ഒരു മാതൃകയിലുള്ള ലേബൽ ..
Outline: സ്ക്രിപ്റ്റ് കമാൻഡുകളെക്കുറിച്ച്. സ്ക്രിപ്റ്റ് കമാൻഡുകൾ എങ്ങനെ എഴുതാം. സ്ക്രിപ്റ്റ് കൺസോൾ എങ്ങനെ ഉപയോഗിക്കാം. സ്ക്രിപ്റ്റ് ആജ്ഞകൾ ഉപയോഗിച്ച് പ്രൊപ്പിന്റെ പ്രദർശനം മാറ്റുക. ആറ്റ..
Outline: അലിസൈക്ളിക് മോളിക്യൂൾസ് മാതൃകകൾ സൃഷ്ടിക്കുക. ഉദാഹരണം: സൈക്ലോഹെക്സെൻ. ആരോമാറ്റിക്ക് മോളിക്യൂൾസ് മാതൃക സൃഷ്ടിക്കുക. ഉദാഹരണം: ബെൻസിൻ. തന്മാത്രകളുടെ ഉപരിതല ടോപ്പോളജി പ്രദർശിപ്പിക്..
Outline: കെമിക്കൽ സ്ട്രുക്ചാർ ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് (PubChem) രാസഘടകങ്ങൾ ലോഡ് ചെയ്യുക. ഫീനോൾ ഘടന ലോഡുചെയ്ത് പാരാ-അമിനോ ഫീനോൾ ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യുക. കൊളസ്ട്രോളിന്റെ ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുകയും ഇരട്..
Outline: CIF (ക്രിസ്റ്റലോഗ്രഫിക് ഇൻഫർമേഷൻ ഫയൽ) ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യുക ക്രിസ്റ്റലോഗ്രഫി ഓപ്പൺ ഡാറ്റാബേസ് (COD). Jmol ൽ CIF ഫയലുകൾ തുറക്കുക. Jmol പാനലിലുള്ള യൂണിറ്റ് സെൽ, യൂണിറ്റ് സെൽ പരാമീറ..
Outline: പ്രോട്ടീൻ ഡാറ്റാബാങ്കിൽ (പി.ഡി.ബി) നിന്നുള്ള പ്രോട്ടീനുകളുടെ ലോഡ് സ്റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് .pdb ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക. ..
Outline: പിഡിബി കോഡ് ഉപയോഗിച്ച് Hexokinase ന്റെ സ്റ്റേക്ച്ചർ ലോഡ് ചെയ്യുക. സെക്കണ്ടറി സ്റ്റേക്ച്ചർ ഡിസ്‌പ്ലൈ പരിഷ്ക്കരിക്കുക. ആക്റ്റീവ് സൈറ്റിലെ അമിനോ ആസിഡ് ശേഷിപ്പുകൾ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക..
Outline: 1. മീഥേൻ തന്മാത്രയിൽ ആറ്റങ്ങളിലൂടെ ലൈൻസ് (C2, C3 ഭ്രമണ അക്ഷങ്ങൾ) വരയ്ക്കുക. 2. അച്ചുതണ്ടിനടിയിലൂടെ തന്മാത്രകളെ സ്പിൻ ചെയ്ത റൊട്ടേറ്റ്‌ ചെയ്യുകയും ചെയ്യുക. 3. മീഥേൻ തന്മാത്രയിൽ ആ..
Outline: സ്ക്രിപ്റ്റ് കമാൻഡുകൾ ഉപയോഗിച്ചുള്ള Jmol ആനിമേഷൻ. ഈഥൻ, ഹീമോഗ്ലോബിൻ ഉപയോഗിച്ചുള്ള ആനിമേഷൻ പ്രദർശനം ഉദാഹരണങ്ങൾ. കീവേഡുകൾ, നീക്കൽ, കാലതാമസം, സ്ളാബ്, ലൂപ്പ് എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് സ്ക..
Foss : Jmol Application - Marathi
Outline: Jmol अप्लिकेशन विषयी थोडक्यात वर्णन. सॉफ्टवेअरची आवश्यकता. पूर्वतयारी. उबंटू /लिनक्स सिस्टमवर Jmol अप्लिकेशन उघडणे . प्रोग्राम इंटरफेसचे स्पष्टीकरण करणे (मेनू बार, टूल बार, पोप..
Outline: आण्विक मॉडेल मध्ये हाइड्रोजन फंक्शनल गटासह बदलणे . बॉण्ड्स अॅड आणि डिलिट करणे . अणू अॅड आणि डिलिट करणे . पॉप-अप-मेनू (कॉन्टॅक्सच्युअल मेनू )
Outline: मॉडेल ला रोटेट , झूम , मूव , आणि स्पिन करणे . दृष्य बदलणे . डिसप्ले चा प्रकार बदलणे . अणू आणि बॉण्ड्सचा आकार आणि रंग बदलणे . एक्सेस आणि बाउंड बॉक्स विविध फाईल स्वरुपात इमेज ..