The tutorials in this series are created using Biopython version1.58 on Ubuntu 12.04 and Ubuntu 14.04. Biopython is a collection of Python tools for computational biology and bioinformatics. Biopython contains modules and classes to represent protein sequences, nucleic acid sequences and sequence annotations. Biopython tools can perform common operations such as transcription, translation, obtain complements, reverse complements, parsing, running BLAST etc. We can use Biopython modules to access online databases such as NCBI. Biopython modules can also be used for sequence alignment, phylogenetics, sequence motifs, protein structure etc. Read more
Foss : Biopython - Kannada
Outline: 1. ಯಾವುದೋ ಒಂದು 'DNA ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್'ಅನ್ನು ರಚಿಸುವುದು 2. 'DNA ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್'ಅನ್ನು ನಿಗದಿತ ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ಲೈಸ್ ಮಾಡುವುದು 3. ಎರಡು 'ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್'ಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಿ ಒಂದು ಹೊಸ 'ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್'ಅನ್ನು ತಯಾರಿಸುವುದ..
Outline: * FASTA ಮತ್ತು GenBank ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು NCBI ವೆಬ್ಸೈಟ್ ನಿಂದ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡುವುದು * Bio.SeqIO ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನ ಫಂಕ್ಷನ್ ಗಳನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸಿ, ಡೇಟಾ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಪಾರ್ಸ್ ಮಾಡುವದು * ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ id, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ..
Outline: 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್'ಗಳನ್ನು ರಚಿಸಿ. 'ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್ ಮಾಡ್ಯೂಲ್'ನ ( Bio.SeqIO. write()) '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಿರಿ. 'ಫ..
Outline: 'ಕ್ವೆರಿ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್' ಗಾಗಿ, NCBI BLAST ಸರ್ವೀಸ್ ಮೂಲಕ ಇಂಟರ್ನೆಟ್ ನ ಮೇಲೆ BLAST ಅನ್ನು ರನ್ ಮಾಡುವುದು 'ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್' ಗಾಗಿ blast ಅನ್ನು ರನ್ ಮಾಡಲು, NCBIWWW ಮೊಡ್ಯೂಲ್ ನಲ್ಲಿ qblast ಫ..
Foss : Biopython - Khasi
Outline: Ki jinglong ba kongsan jong ka Biopython. Ki thup jingtip shaphang ban download bad ban install haka Linux Operating System. Shna iaka sequence object naka bynta ka DNA strand ba..
Outline: 1. Pynmih iaka DNA sequence kaba khlem thmu. 2. Slice iaka DNA sequence haki jaka kiba la bthah. 3. Pynsyndait lang iaki ar tylli ki sequence ban pynlong ka sequence kaba..
Outline: Download iaka FASTA bad ki file ka GenBank naka NCBI database website. Parse data files pyndonkam ki jingpyntreikam haka Bio.SeqIO module. Pyndonkam ki jingpyntreikam parse (Bi..
Outline: Shna ia ki Sequence Record Objects. Thoh ia ki sequence files pyndonkam u write function jong ka Sequence Input/Output module( Bio.SeqIO. write()). Pynkylla hapdeng ki file forma..
Outline: Run iaka BLAST naka bynta ka query sequence haka internet lyngba ka NCBI BLAST service. Pyndonkam ka qblast function haka NCBIWWW module ban run iaka blast naka bynta ka nucleot..
Foss : Biopython - Malayalam
Outline: ബയോ പൈതണ് പ്രധാന സവിശേഷതകൾ. ലിനക്സ് ഓപ്പറേറ്റിങ് സിസ്റ്റത്തിൽ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്യുന്നതിനെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾ. തന്നിരിക്കുന്ന ഡിഎൻഎ ക്രോഡിനുള്ള സീക്വൻ വസ്തു സൃഷ്..
Outline: 1. രണ്ടാം ഡി.എൻ.എ.സീക്വൻസ് സൃഷ്ടിക്കുക. 2. നിർദ്ദിഷ്ട സ്ഥാനങ്ങളിൽ ഡിഎൻഎ സീക്വൻസ് സ്ലൈസ് ചെയ്യുക. 3. ഒരു പുതിയ അനുപാതം (Concatenate) രൂപപ്പെടുത്തുന്നതിന് രണ്ട് ശ്രേണികളുമായി ചേ..
Outline: NCBI ഡാറ്റാബേസ് വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് FASTA, GenBank ഫയലുകൾ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യുക. Bio.SeqIO ഘടകത്തിലെ പ്രവർത്തനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഡാറ്റാ ഫയലുകൾ പാഴ്ത്തുക. സീക്വൻസ് ഐഡി, ഫയൽ ഉൾക്കൊള്ളുന്ന സീ..
Outline: സീക്വൻസ് റെക്കോഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് സൃഷ്ടിക്കുക. സീക്വൻ ഇൻപുട്ട് / ഔട്ട്പുട്ട് മോഡ്യൂൾ (Bio.SeqIO. Write ()) റൈറ്റ് ഫംഗ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് സീക്വൻസ് ഫയലുകൾ എഴുതുക. ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾക്കിടയിൽ പരി..
Outline: NCBI BLAST സേവനത്തിലൂടെ ഇന്റർനെറ്റ് വഴി ക്വാറി സീക്വൻസ് BLAST പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക. ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സീക്വൻസ്ന്റെ സ്ഫോടനത്തിന് NCBIWWW ഘടകം ഉപയോഗിച്ചു് qblast ഉപയോഗിയ്ക്കുക. ഔട്ട്പു..
Foss : Biopython - Marathi
Outline: '''Biopython''' चे महत्वाचे वैशिष्ट्ये लिनक्स ऑपरेटिंग सिस्टम वर डाउनलोड व प्रतिष्ठापन संबंधित माहिती. दिलेल्या '''DNA''' स्ट्राँड साठी एक सीक्वेन्स ऑब्जेक्ट तयार करणे. '''mRNA..
Outline: एक यादृच्छिक DNA सीक्वेन्स निर्माण करणे. विशिष्ट ठिकाणी DNA सीक्वेन्स भागणे. एक नवीन सीक्वेन्स तयार करण्यासाठी दोन सीक्वेन्सला एकत्र करणे ( कंकॅटेनेट). सीक्वेन्सची लांबी शोधणे. ..
Outline: '''NCBI''' डेटाबेस वेबसाइट मधून '''FASTA''' आणि '''GenBank''' फाइल्स डाउनलोड करणे. Bio.SeqIO मॉड्यूल मध्ये '''functions''' वापरुन डेटा फाइल्स पार्स करणे. माहिती एक्सट्रॅक्ट करण्य..
Outline: '''Sequence Record Objects''' तयार करणे. '''Sequence Input/Output''' मॉड्यूलचे '''write''' फंक्शन वापरुन सीक्वेन्स फाइल्स लिहीणे. '''file formats''' दरम्यान रुपांतर करणे. लांबी ..
Outline: '''NCBI BLAST''' सर्विस वापरुन इंटरनेटवर क्वेरी सीक्वेन्स साठी '''BLAST''' रन करणे. '''NCBIWWW ''' मॉड्यूल मध्ये '''qblast function''' वापरून न्यूक्लियटाइड सीक्वेन्स साठी ब्लास्ट ..
Foss : Biopython - Sanskrit
Outline: बयोपैथन् प्रमुखलक्षणानि Linux आपरेटिङ्ग् सिस्टम् मध्ये डौन्-लोड् तथा इन्स्टाल्-करणविषये विवरणम् दत्तस्य ‘DNA स्ट्र्याण्ड्’निमित्तं किञ्चन सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् रचनम् DNA सीक्व..